Poleg vzdrževanja deburing stroja je treba po vsaki uporabi očistiti ostanke vode in obdelka na delovni površini deburing stroja. Če prah na natisnjenem vezju ni odstranjen, bo z lahkoto absorbiral vlago in jedke stvari v zraku v daljšem časovnem obdobju, korodiral originalno majhno prevodno bakreno kožo in povzročil okvaro stroja. Vedno očistite prah znotraj električne škatle, kot so prah na uporu električne energije, prah na izpustnem mostu, še posebej prah na tiskani vezni plošči, to bo pomagalo toplotno disipation učinek električnih komponent.
Vzdrževanje vrteče glave deburing stroja je podobno kot v vodni črpalki deburing stroja. Vrteča glava deluje tudi pod visokim pritiskom, njene tesnila pa je treba redno nadomeščati. Če pride do uhajanja vode in ga nato zamenjamo, je možno, da je voda prodrla v ležaj. Izguba je še večja. Vzdrževanje vodne črpalke strojnega orodja za perforiranje CNC EDM. Vodna črpalka deburing stroja deluje pod delovnim tlakom 6Mpa. Zakrivljeni ležaj v notranjosti je pod zelo težkim pritiskom. Če maziva ne zamenjate takoj po obdobju dela, bo to povzročilo zelo resne posledice. Tega zlahka spregledajo številni uporabniki izkašljevalnega stroja in na to moramo biti pozorni. Ker je vodna črpalka zelo pomembna komponenta v deburing stroju, če gre s to komponento kaj narobe, bo vplivala na uporabo celotnega strojnega orodja.